Type II モデルでも同様に を導入すると, の同時分布は
EM アルゴリズムを行うために必要な条件付き確率は
Type II の場合も と を同時に最適化することは困難であるので, まず, を固定し, を求める. すると,
ここで はそれぞれ,次の ように計算される統計量である.
次に を固定して を求める.