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産総研
last updated 2024.3.15
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Profile
和泉 博（Hiroshi Izumi）
国立研究開発法人産業技術総合研究所
環境創生研究部門（ウェブサイト）
環境機能活用研究グループ　主任研究員
〒305-8569 茨城県つくば市小野川１６－１　つくば西
TEL：050-3522-5618
E-mail：izumi.h*aist.go.jp（*を@に変更して使用してください。）
研究内容
  • 機能性有機分子の立体配座コード解析
  • Structural Pattern Analysis of Organic Molecules Using Conformational Code for Structure-Activity Relationship Study
  • 機能性有機分子の多くは液体の状態で原子間結合の回転の自由度によりその形（立体配座）を変化させながら働いています。多くの分子モデル表示ソフトウェアではワンボタンでキラリティーを表記することは可能ですが、立体配座を表記するものは存在していませんでした。そこで、機能性有機分子のコンフォメーションをコード化してわかりやすくすることで、煩雑な構造解析の検証に応用する研究を行っています。
  • タンパク質超二次構造コードディープラーニング解析
  • SSSCPreds_ver3.22 with SSSCPreds_docx_ver1.20 (April 21, 2023) を公開しました。ディープニューラルネットワークを用いて予測されたフレキシブルなコンフォーメーションをもつアミノ酸配列をグリーンのハイライトでわかりやすく表示可能です（https://staff.aist.go.jp/izumi.h/SSSCPreds/index-e.html）。
  • SSSCview_ver2.21 (December 14, 2023) を公開しました。タンパク質構造データバンク (PDB) ファイルを超二次構造コード (SSSC) 配列ファイルに変換し、各アミノ酸残基の主鎖のコンフォメーションをカラー表示可能です（https://staff.aist.go.jp/izumi.h/SSSCPreds/index-e.html）。
  • 本研究はJSPS科研費 JP22K05073の助成を受けて行われています。
研究実績

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