■冨田 峻介 - Shunsuke TOMITA


□現職
 産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 
 ナノバイオデバイスグループ 研究員


□生年月日
 1984年10月15日生


□学歴
 2007年3月 筑波大学 第三学群 工学基礎学類
         物質・分子工学専攻 卒業

 2009年3月 筑波大学 大学院数理物質科学研究科
         電子・物理工学専攻博士前期課程 修了

 2011年7月 筑波大学 大学院数理物質科学研究科
         電子・物理工学専攻博士後期課程 修了

 最終学歴: 博士(工学)・筑波大学
       
   


□職歴
 2011年8月-2012年3月
 筑波大学 大学院数理物質科学研究科 電子・物理工学専攻 博士研究員 (白木研究室

 2012年4月- 2014年3月
 東京大学 大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 (吉本研究室
 日本学術振興会特別研究員-PD

 2014年4月-現在
 産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 ナノバイオデバイスグループ
 研究員

□論文

  1. A multi-fluorescent DNA/graphene oxide conjugate sensor for signature-based protein discrimination
    Shunsuke Tomita*, Sayaka Ishihara, Ryoji Kurita*
    Sensors, in press. [Link].
    Special Issue "Dedication to Professor Eiichi Tamiya: Over 30 Years of Outstanding Contributions to the Field of Sensors and Biosensors"

  2. One-step identification of antibody degradation pathways using fluorescence signatures generated by cross-reactive DNA-based arrays
    Shunsuke Tomita*, Ayumi Matsuda, Suguru Nishinami, Ryoji kurita, Kentaro Shiraki
    Analytical Chemistry, 89, 7818-7822 (2017). [Link].

  3. Noncovalent PEGylation through protein-polyelectrolyte interaction: Kinetic experiment and molecular dynamics simulation
    Takaaki Kurinomaru, Kengo Kuwada, Shunsuke Tomita, Tomoshi Kameda, Kentaro Shiraki
    The Journal of Physical Chemistry B, 121, 6785-6791 (2017). [Link].

  4. Environment-sensitive turn-on fluorescent polyamino acid: Fingerprinting protein populations with post-translational modifications
    Shunsuke Tomita*, Sayaka Ishihara, Ryoji Kurita*
    ACS Applied Materials & Interfaces
    , 9, 22970-22976 (2017). [Link].

  5. Small spheroids of adipose-derived stem cells with time-dependent enhancement of IL-8 and VEGF-A secretion
    Furuhata Yuichi, Yuka Kikuchi, Shunsuke Tomita, Keitaro Yoshimoto
    Genes to Cells, 21, 1380-1386 (2016). [Link].

  6. Artificial modification of an enzyme for construction of cross-reactive polyion complexes to fingerprint signatures of proteins and mammalian cells
    Shunsuke Tomita*, Osamu Niwa, Ryoji Kurita*
    Analytical Chemistry, 88, 9079-9086 (2016). [Link]

  7. Noncovalent PEGylation-based enzyme switch in physiological saline conditions using quaternization polyamines
    Kengo Kuwada, Takaaki Kurinomaru, Shunsuke Tomita, Kentaro Shiraki
    Colloid and Polymer Science, 294, 1551-1556 (2016). [Link]

  8. Wrap-and-Strip technology of protein–polyelectrolyte complex for biomedical application
    Kentaro Shiraki, Takaaki Kurinomaru, Shunsuke Tomita
    Current Medicinal Chemistry, 23, 276-289 (2016). [Link]

  9. Small amine molecules: Solvent design toward facile improvement of protein stability against aggregation and inactivation
    Kentaro Shiraki, Shunsuke Tomita, Naoto Inoue
    Current Pharmaceutical Biotechnology, 17, 116-125 (2016). [Link]

  10. The use of an enzyme-based sensor array to fingerprint proteomic signatures of sera from different mammalian species
    Shunsuke Tomita*, Saki Yokoyama, Ryoji Kurita, Osamu Niwa, Keitaro Yoshimoto*
    Analytical Sciences, 32, 237-240 (2016). [Link]

  11. A Polyion Complex Sensor Array for Markerless and Noninvasive Identification of Differentiated Mesenchymal Stem Cells from Human Adipose Tissue
    Shunsuke Tomita*, Miho Sakao, Ryoji Kurita, Osamu Niwa, Keitaro Yoshimoto*
    Chemical Science, 6, 5831-5836 (2015). [Link]

  12. Enzymatic fingerprinting of structurally similar homologous proteins using polyion complex library constructed by tuning PEGylated polyamine functionalities
    Shunsuke Tomita*, Tomohiro Soejima, Kentaro Shiraki, Keitaro Yoshimoto*
    Analyst, 139, 6100-6103 (2014).
    [Link]

  13. Charge‐Separated Fmoc‐Peptide β‐Sheets: Sequence‐Secondary Structure Relationship for Arranging Charged Side Chains on Both Sides
    Toru Nakayama, Taro Sakuraba, Shunsuke Tomita, Akira Kaneko, Eisuke Takai, Kentaro Shiraki, Kentaro Tashiro, Noriyuki Ishii, Yuri Hasegawa, Yoichi Yamada, Reiji Kumai, Yohei Yamamoto
    Asian Journal of Organic Chemistry, 3, 1181-1188 (2014).
    [Link]

  14. Enzyme hyperactivation system based on a complementary charged pair of polyelectrolytes and substrates
    Takaaki Kurinomaru, Shunsuke Tomita, Yoshihisa Hagihara, Kentaro Shiraki
    Langmuir, 30, 3826-3831 (2014).
    [Link]

  15. Polyion complex libraries possessing naturally occurring differentiation for pattern-based protein discrimination
    Shunsuke Tomita*, Keitaro Yoshimoto*
    Chemical Communications, 49, 10430-10432 (2013). [Link]

  16. Arginine inhibits adsorption of proteins on polystyrene surface
    Yui Shikiya, Shunsuke Tomita, Tsutomu Arakawa, Kentaro Shiraki
    PLoS ONE, 8, e70762 (2013).
    [Link]

  17. Oligoethylene glycols prevent thermal aggregation of α-chymotrypsin in a temperature-dependent manner: Implications for design guidelines
    Shunsuke Tomita, Yumiko Tanabe, Kentaro Shiraki
    Biotechnology Progress, 27, 855-862 (2013)
    . [Link]

  18. Glutathione ethylester, a novel protein refolding reagent, enhances both the efficiency of refolding and correct disulfide formation
    Len Ito, Masaki Okumura, Kohsaku Tao, Yusuke Kasai, Shunsuke Tomita, Akiko Oosuka, Hidetoshi Yamada, Tomohisa Shibano, Kentaro Shiraki, Takashi Kumasaka, Hiroshi Yamaguchi
    The Protein Journal, 31, 499-503 (2012)
    . [Link]

  19. Different mechanisms of action of poly(ethylene glycol) and argnine on thermal inactivation of lysozyme and ribonuclease A
    Shunsuke Tomita, Yukio Nagasaki, Kentaro Shiraki
    Biotechnology and Bioengineering, 109, 2543-2552 (2012)
    [Link]

  20. Improved Complementary Polymer Pair System: Switching for Enzyme Activity by PEGylated Polymers
    Takaaki Kurinomaru, Shunsuke Tomita, Shinpei Kudo, Sumon Ganguli, Yukio Nagasaki, Kentaro Shiraki
    Langmuir, 28, 4334-4338 (2012), equally contributed.
    [Link]

  21. Poly(acrylic acid) is a common non-competitive inhibitor for cationic enzymes with high affinity and reversibility
    Shunsuke Tomita, Kentaro Shiraki
    Journal of Polymer Science Part A: Polymer Chemistry, 49, 3835-3841 (2011).
    [Link]

  22. Arginine controls heat-induced cluster-cluster aggregation of lysozyme at around the isoelectric point
    Shunsuke Tomita, Hiroki Yoshikawa, Kentaro Shiraki
    Biopolymers, 95, 695-701 (2011).
    [Link]

  23. Why do solution additives suppress the heat-induced inactivation of proteins? Inhibition of chemical modifications
    Shunsuke Tomita, Kentaro Shiraki
    Biotechnology Progress, 27, 855-862 (2011).
    [Link]

  24. Improving the heat resistance of ribonuclease A by the addition of poly(N,N-diethylaminoethyl methacrylate)-graft-poly(ethylene glycol) (PEAMA-g-PEG)
    Sumon Ganguli, Keitaro Yoshimoto, Shunsuke Tomita, Hiroshi Sakuma, Tsuneyoshi Matsuoka, Kentaro Shiraki, Yukio Nagasaki
    Macromolecular Bioscience, 10, 853-859 (2010).
    [Link]

  25. Enzyme switch by complementary polymer pair system (CPPS)
    Shunsuke Tomita, Len Ito, Hiroshi Yamaguchi, Gen-ichi Konishi, Yukio Nagasaki, Kentaro Shiraki
    Soft Matter, 6, 5320-5326 (2010). [Link]
    Selected as the back cover of the issue


  26. Solution additives to suppress protein deterioration: Non-covalent aggregation and covalent modification
    Shunsuke Tomita, Kentaro Shiraki
    Journal of Japanese Society for Extremophiles, 9, 81-89 (2010)


  27. Regulation of lysozyme activity based on thermotolerant protein/smart polymer complex formation
    Sumon Ganguli, Keitaro Yoshimoto, Shunsuke Tomita, Hiroshi Sakuma, Tsuneyoshi Matsuoka, Kentaro Shiraki, Yukio Nagasaki
    Journal of the American Chemical Society, 131, 6549-6553 (2009).
    [Link]

  28. Synergistic effect of polyethylene glycol with arginine on the prevention of heat-induced aggregation of lysozyme
    Shunsuke Tomita, Hiroyuki Hamada, Yukio Nagasaki, Kentaro Shiraki
    Journal of Physics: Conference Series, 106, 012022-012026 (2008).
    [Link]

  29. Amidated amino acids are prominent additives to prevent heat-induced aggregation of lysozyme
    Tsuneyoshi Matsuoka, Shunsuke Tomita, Hiroyuki Hamada, Kentaro Shiraki
    Journal of Bioscience and Bioengineering, 103, 440-443 (2007)
    . [Link]


□解説

  1. 交差反応的光学フィンガープリンティングを利用するタンパク質センシング
    冨田 峻介、吉本 敬太郎、丹羽 修、栗田 僚二
    分析化学, 66, 1-10 (2017)
    [Link]

  2. 非怠け者の元旦働き
    冨田 峻介
    ぶんせき, 497, 180 (2016)
    [PDF]

  3. セクレトームフィンガーパタン分析を実現するバイオマテリアル設計
    冨田 峻介、吉本 敬太郎
    バイオマテリアル―生体材料―, 34, 46-49 (2016)


  4. 交差反応型センサアレイを用いるクルードなタンパク質溶液の評価
    冨田 峻介、吉本 敬太郎
    生物工学会誌, 93, 285-288 (2015)
    . [Link] [PDF]

  5. バイオマテリアルの夢を語る
    冨田 峻介
    バイオマテリアル―生体材料―, 32, 333 (2014)


  6. 細胞の形態的特徴を利用する間葉系幹細胞分化状態の予測管理
    冨田 峻介
    ぶんせき, 471, 132 (2014)


  7. ナノ会合体と細菌の非特異的な相互作用を利用する細菌種の同定
    冨田 峻介
    ぶんせき, 456, 722 (2012)


  8. タンパク質熱凝集を抑制する化合物
    松岡 常吉、冨田 峻介、平野 篤
    蛋白質科学会アーカイブ, 1, e041 (2008)


□特許

  1. 蛋白質を含む液状組成物中における蛋白質の安定化方法
    特許第5119545号


□招待講演・教育活動・所内/外活動

  1. 非特異的な相互作用を活用する―タンパク質の特徴パターンを出力できる分子群による生体試料メトリクス
    冨田 峻介

    蛋白研セミナー:産業応用を志向するタンパク質溶液研究, 大阪大学蛋白質研究所 (2017/9)

  2. 機械学習を活用したタンパク質分析法の開発と細胞評価への応用
    冨田 峻介

    日本分析化学会第66年会, 東京理科大学葛飾キャンパス (2017/9)

  3. 分子アレイによって取得したフィンガープリントを利用する生体試料メトリクス
    冨田 峻介

    第4回TLSK"ピッチ会", 筑波大学 (2017/9)

  4. タンパク質の特徴情報を出力できる高分子アレイを利用したバイオメトリクス技術
    冨田 峻介

    JST新技術説明会, JST東京本部別館1Fホール (2017/7)

  5. Environment-sensitive polymers for fingerprinting of protein characteristics
    Shunsuke Tomita
    , Sayaka Ishihara, Ryoji Kurita
    International Symposium on Pure & Applied Chemistry (ISPAC) 2017, Hotel Continental Saigon, Vietnam (2017/6)

  6. 生物がもつパターン認識機能に学ぶバイオセンシング
    冨田 峻介

    安藤研・佐々木研合同セミナー2017, 東洋大学熱海研修センター (2017/3)

  7. Libraries of block-copolymer/enzyme complexes for protein fingerprinting:
    Toward markerless and noninvasive stem cell evaluation
    Shunsuke Tomita

    International Symposium on Pure & Applied Chemistry (ISPAC) 2016, Borneo Convention Centre Kuching, Malaysia
    (2016/8)

  8. 味覚に学ぶバイオ分析: マーカー分子に頼らない生体試料センシングを目指して
    冨田 峻介
    平成 27 年度日本分析化学会関東支部若手交流会, 晴海グランドホテル, (2015/6)

  9. キャリアデザインセミナー, 山形大学フロンティア有機材料システム創生フレックス大学院 (2015-)

  10. 日本分析化学会関東支部若手の会幹事 (2015-)

  11. 平成27年度 バイオメディカル研究部門若手会 幹事 (2014-2016)


□受賞

  1. 日本分析化学会, 2017年度日本分析化学会奨励賞 (2017/9)
  2. International Symposium on Pure & Applied Chemistry (ISPAC) 2017, Lecture Award (2017/6)
  3. 2013年度日本分析化学会関東支部, 新世紀新人賞 (2014/1)
  4. 2nd International Conference on Biomaterials Science, Travel Award (2013/3)
  5. 第21回日本MRS学術シンポジウム、奨励賞 (2011/12)
  6. 第10回日本蛋白質科学会年会、ポスター賞 (2010/6)
  7. Second International Symposium on Atomic Technology, Poster Award (2007/1))


□研究助成金

  1. 日本学術振興会 挑戦的研究(萌芽) (2017/6-2019/3)分担
  2. 日本学術振興会 基盤研究B (2017/4-2020/3)分担
  3. 日本学術振興会 若手研究A (2017/4-2021/3)代表
  4. 日本学術振興会 挑戦的萌芽研究 (2016/4-2018/3)代表
  5. 産総研・筑波大学「合わせ技ファンド」 (2015/7-2016/3)代表
  6. 日本学術振興会 若手研究B (2014/4-2016/3)代表
  7. 日本学術振興会 基盤研究B (2014/4-2015/3)分担
  8. 総合工学振興財団 研究奨励金 (2012/9-2014/3)代表
  9. 日本学術振興会 特別研究員奨励費 (2012/4-2014/3)代表
  10. 日本科学協会 笹川科学研究助成 (2011/4-2012/2)代表
  11. つくばダイアモンド研究奨励費 (2010/6-2011/3)代表


ホームページ作成(勉強中)

  1. バイオメディカル研究部門 ナノバイオデバイス研究グループ [Link]
  2. 日本分析化学会 関東支部 若手の会 [Link]