時計遺伝子変異体:花井修次@産総研

Clock gene mutants: S. Hanai@AIST

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時計遺伝子 Clock Genes Allele アリル
(Flyでは代表的なアリルのみ)
変異源
Mutagen
Class 表現型 (free running under DD) 文献 (M: mutant, G: gene isolation)
Period mouse Per1 Per1tm1Brd(Per1Brdm1) KO   短周期 (-1.1h)
Per2とWKOで無周期
M: Zheng2001
Per1tm1Drw (Per1ldc) KO   Arrhythmic (無周期) M: Bae2001
Per1tm1Saco KO   短周期 M: Cermakian2001
mouse Per2 Per2tm1Brd(Per2Brdm1) KO   短周期→無周期
発がん増加(Fu2002)
M: Zheng1999
Per2tm1Ccl KO   同上(tm1Brdと同じグループの別コンストラクト) M: Fu2002
Per2tm1Drw (Per2ldc) KO   無周期 M: Bae2001
Per2tm1Jt(Per2Luciferase)  KI   Per2のC末にLucを融合
行動は正常
M: Yoo2004
mouse Per3 Per3tm1Brd(Per3Brdm1) KO   短周期(0.5 h) M: Shearman2000
fly period per01 (per0) (Q464@) EMS A, R 無周期 M: Konopka1971
G: Bargiello1984,
Zehring1984, Reddy1984
perL1 (perL) (V243D) EMS Hypo 長周期 28-30 h M: Konopka1971
pers (perS) (S589N) EMS Hypo 短周期 19 h M: Konopka1971?
timeless fly timeless tim01 (tim0) Δ2-3 A, R Arrhythmic M: Sehgal1994
G: Myers1995
timS1 EMS SD Homo, 21.1 +/- 0.2 h; hetero, 22.2 +/- 0.1 M: Rothenfluh2000Genetics
timL1 (K586M) EMS SD Homo, 27.8; hetero, 25.5 M: Rothenfluh-Hilfiker1995
G: Rothenfluh2000Genetics
timUL (E260K) EMS SD Homo, 32.8; hetero, 25.6 M: Rothenfluh-Hilfiker1997
G: Rothenfluh 2000Neuron
Clock mouse Clock Clockm1Jt (Clockdelta19) ENU SD 長周期、無周期
いわゆるClockマウス
M: Vitaterna1994
G: King1997,
Antoch1997
Clocktm1.1Drw (Clockdelta5-6) KO A 正常周期
Npas2とWKOで無周期
M, G: Debruyne2006
(Debruyne2007)
fly Clk ClkJrk  (Q776@)
EMS SD Homo, 無周期;
hetero, 半数無周期
Allada1998
Clkar (Missense, exon 2/intron 2 splice site) EMS
A, R Homo, 無周期;
hetero, 正常
Allada2003
Npas2 mouse Npas2 Npas2tm1Slm (NPAS-deltabHLH, NPAS2-lacZ) KO ? 記憶、睡眠に異常 Garcia2000
Bmal mouse Bmal1 Arntltm1Bra KO A, R Homo, 無周期;
hetero, 正常
Bunger2000
Arntltm1.1Weit KO, conditinal Homo+ubiquitous Cre, 無周期 Storch2007
mouse Bmal2 NA - - - -
fly cycle cyc01 (A586T) EMS A, R Homo, 無周期;
hetero, 正常
Rutia1998
Cry mouse Cry1 Cry1tm1Jhjh KO A 短周期。Cry2tm1JhjhとWKOで無周期。 van der Horst1999
Cry1tm1Asn KO
(Reporter)
A 短周期。Cry2tm1AsnとWKOで無周期 Vitaterna1999
mouse Cry2 Cry2tm1Asn KO A   Thresher1998
Cry2tm1Jhjh KO A 長周期。Cry1とWKOで無周期。 van der Horst1999
fly cry cryb (crybaby) (D410N) EMS A, R 短い光パルスによるPhase shiftが起きない。 Stanewsky1998
crym (truncates the last 19 aa) EMS Hypo   Busza2004
cry0 KO A, R crybabyと同様 Dolezelova2007
vrille 
E4BP4
fly vrille vri1 EMS Anti Homo, letahl,
hetero, -0.4~0.8 h
Blau1999
mouse E4BP4 NA  -    -
Pdp1
Dbp
fly Pdp1 Pdp1P205 Δ2-3 A, R Homo, letahl,
hetero, +0.5 h
Cyran2003
mouse Dbp Dbptm1Schb (Dbpnull) KO   Dbp, Tef, Hlf 三重変異で Lethal seizures (てんかん)
活動、時計遺伝子発現は正常
Lopez-Molina1997
mouse Tef Teftm1Schb KO   Gachon2004
mouse Hlf Hlftm1Schb KO  
cwo fly cwo PBac{WH}stich1f05073 PBac   活動リズムの減少 Lim2006松本2006, Kadener2006
PBac{RB}stich1e04207 PBac  
Dec mouse Dec1
(Sharp2)
Bhlhe40tm1Tan KO   CCGの一部で発現低下 Sun2001
Gréchez-Cassiau2003
Bhlhe40tm1Rhli KO     Jiang2008
Bhlhe40tm1.1Rhli KO     Jiang2008
mouse Dec2
(Sharp1)
Bhlhe41tm1Mjro KO     Rossner2008
Rev-erb alpha mouse Rev-erb a Nr1d1tm1Ven KO     Chomez2000
Nr1d1tm1Schb KO   短周期、光による位相前進の促進 Preitner2002
ROR alpha mouse Ror a Rorasg 自然発生
spontaneous
  短周期(Sato2004) M: Sidman1962
G: Hamilton1996
Roratm1Vgi KO   die between 24 to 28 days after birth Dussault1998
Roratm1Mba KO     Steinmayr1998
CK1e
CK1d
hamster CK1epsilon
(Mesocricetus auratus)
ゴールデンハムスター
tau (R178C) 自然発生
spontaneous
+/+, 24h; +/tau, 22 h; tau/tau, 20 h M: Ralph1988
G: Lowrey2000
mouse CKIe Csnk1etm1Asil KO Point mutation
(tauアリル)
tau/+, 21.8 h;
tau/tau, 20.0 h
Meng2008
Csnk1etm1.1Asil KO Deletion   Meng2008
mouse
CKId
CK1delta(D2) KO, conditinal Liver-specific disruption, +2 h (Per2::luc) Etchegaray2009
fly double-time (dco) dcoS (dbtS) EMS   dcoS/+, 21.8 h; dcoS/dcoS, 18h M, G: Kloss1998
, Price1998)
dcoL (dbtL) EMS   dcoL/+, 24.9 h; dcoL/dcoL, 26.8 h
sgg
Gsk3b
mouse Gsk3b Gsk3btm1Jrw KO A, R Lethal E13.5 - E14.5 Hoeflich2000
Gsk3btm1Grc KO A, R   Stankunas2003
fly sgg sgg32/sggM11; sgghs.p 26 h (sggは発生に必須なので、hs-sggでレスキューして成虫を得た) Martinek2001
sggEP1576 21 h (tim-Gal4での過剰発現
Fbxl3 mouse Fbxl3 Fbxl3Afh ENU Hypo? Homo, +3 h; hetero, +0.5 ~ 1 h Godinho2007
Fbxl3Ovtm ENU Hypo? Homo, +3 h; hetero, +0.7 h Siepka2007
slmb fly slmb slmb8 slmbL.hs Arrhythmic (無周期)(slmbは発生に必須なので、hs-slmbでレスキューして成虫を得た) Grima2002
遺伝子名、アリル、学名は全てイタリックが正しいが、見難いので割愛してあります。
他にも行動解析されている変異体があります。順次追加する予定です。

Class
D: domionant 優性  (ヘテロ(+/-, +/mutant) でも完全な影響がある)
SD: semidominant 不完全優性、半優性 (ヘテロでも多少は影響がある)
R: recessive 劣性 (ヘテロでは影響がない、)
A: amorph (null) 機能喪失
Anti: antimorph (dominant negative)
Hypo: Hypomorph 機能低下
Mutagen
KO: Targetted gene knock out
KI: Knockin
アリルの正式名称は「targeted mutation 1, David R Weaver → tm1Drw 」の様に提供者の名前の子音3文字になっているようです。
EMS: ethyl methanesulfonate (chemical mutagen)
ENU: N-Nitroso-N-Ethylurea; N-Ethyl-N-Nitroso-Urea
Δ2-3: delta2-3 (Transposase of P element)
PBac: piggyBac transposase
Spontaneous: spontaneous mutation in stock or natural population

短周期: short period
長周期: long period
無周期: arrhythmic
正常: normal