Clock Gene in Animal 更新: 2009.3.18  サイトマップ
時計遺伝子の一覧 時計遺伝子の概要 動物モデル(英語) 動物の一覧

動物の時計遺伝子

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ドメイン
機能
遺伝子名

ヒト遺伝子名[別名]
(ショウジョウバエ遺伝子名)
動物種  (学名。マウスを乗せると説明が出ます)
Homo sapiens Mus musculus Gallus gallus Xenopus tropicalis Xenopus laevis Danio rerio Ciona intestinalis Branchiostoma floridae Strongylocentrotus purpuratus Apis mellifera Anopheles gambiae Drosophila melanogaster Caenorhabditis elegans Nematostella vectensis Trichoplax adhaerens
bHLH
PAS
PER (period) 3
3 2 3 2 4
0 1 0 1
1 1
1 00
CLOCK, NPAS2  a  2 2 2 2
1 3 0 1 1 1 1 1
0 10
ARNTL [BMAL] (cycle) 2 2 2 2 1 3 0 1 1 1 1 1
0 10
bHLH
Orange
BHLHE40,41 [DEC1, 2] 2 2 1 2 1 2 0 1b 0 0 0
0 0 00
(cwo) 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1
0 00
HLH Id1-4 4
4
4
3 3 5 0 1 1 1 1 1 0 1 0
bZIP NFIL3 [E4BP4] (vrille) 1 1
1 1 1 1 2 1 1 1 1 1
1 00
DBP, HLF (Pdp1) c 3
3
2 2 1 5 1
3 3 2 2 4
3 53
Nuclear
receptor
NR1D1, 2 [REV-ERB] 2 2 1 1 1 5 1 1 1 1 1 1 1 00
RORA , B, C [NR1F1-3] 3 3 2 3 1 5 1 1 1 1 1 1 1 00
SIR2 SIRT1-7  7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 4 5 2 78
photolyase
FAD bind
CRY  d 2 2 2 1
1 5
0 1 1 1 1 0 0 1
0
(cry) e 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1
0 00
PHOTOLYASE f 0 0 2 3 3 3 1g 2 1 0 2 2 0 1h2g
CRY-DASH f 0 0 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1h0
  (timeless)i 0
0 0 0
0 0 0 0 1 0 1 1
0 00
Kinase GSK3 (shaggy)
2 2 1 2 2 4 1 1 1 1 1 1
1 11
CSNK1 (dco/dbt)
7 7 4 7 6 8 1j 5 4 3 3 3
3 43
CSNK2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1
1 11
F-box
(Ubi-ligase)
BTRC [FWD1](slimb)
2 2 2
1
1 2 1 1 1 1 1 1
1 11
FBXL3, 21 [overtime, after-hours] 2 2 2 1 1 3 0 1 1 1 0 0 0 00
FBXL15 (jetlag) 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1
0 10

2 1 0
数字はその種で見つかったホモログの数を示します。 (例: Rora, Rorb, Rorc = 3)
3
紫: 機能喪失変異体は生存し、無周期と報告されました。
3
赤: 変異動物の活動周期に変化が報告されました。
3
黄: 時計機能が培養細胞で報告されました。
3
青: 時計機能は未知か、変異体の活動は正常と報告されました。

遺伝子名は基本的にHGNC規定されたヒト遺伝子シンボルで表記します。
別名はカギ括弧に記します: [別名]。
ショウジョウバエ遺伝子名は丸括弧に示しました: (fly gene)。
動物名については「動物の一覧ページ」をご参照下さい。

脚注
a. NPAS2CLOCK のパラログと見なしました。
b. この遺伝子は DECcwoのどちらとも判別できません。
c. 数字には giant 及び ces-2 様遺伝子も含みます。
d. ほ乳類型CRY
e. ショウジョウバエ型 CRY
f. 時計への関与が知られていないファミリーを参照のために示しました。
g. バクテリア型光回復酵素に似ています。
h. 他に4つの PHR, CRY-DASH 様遺伝子が見つかっています。
i. 脊椎動物型TIMELESStimeout に分類しリストから外しました。timeout は全ての動物で見つかりました (→ timeless ホモログリストを参照).
j. CSNK1A


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