Tadashi Imanishi

北大講義資料

２０１２年「機能バイオインフォマティクス特論」スライド（PDFファイル）

最終更新日：　２０１２年５月１７日

５月１７日　第１回「バイオインフォマティクスとは」
５月１７日　第２回「ゲノム知識発見」（１）
５月１８日　第３回「ゲノム知識発見」（２）
５月１８日　第４回「ゲノム多様性」（１）
５月３１日　第５回「ゲノム多様性」（２）
５月３１日　第６回「ゲノム多様性」（３）
６月１日　第７回「機能アノテーション」（１）
６月１日　第８回「機能アノテーション」（２）
６月１４日　第９回「テキストマイニング」
６月１４日　第１０回「バイオ情報データベース」（１）
６月１５日　第１１回「バイオ情報データベース」（２）
６月１５日　第１２回「バイオ情報データベース」（３）
課題１．ゲノム配列からの発見クイズ
アラインメント作成をエクセルで実行した例
アラインメント作成のためのエクセルのテンプレート（DP_template.xls）
レポート課題（締切は2012年8月31日必着）(NEW)

注１）ファイルを開く際にパスワードが必要です。パスワードは第１回の講義に使った部屋番号です。
注２）実際に講義で使ったスライドとは一部異なります。
注３）このスライドは講義の復習のために個人としてお使いください。他の目的には使わないでください。

主なデータベースへのリンク

NAR Database Categories List, http://www.oxfordjournals.org/nar/database/c/
BioMed Central, Databases on the web, http://databases.biomedcentral.com/browsecatalog
WING, http://wing.jst.go.jp/
WINGpro, http://wingpro.lifesciencedb.jp/

DDBJ, http://www.ddbj.nig.ac.jp/
NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
EBI, http://www.ebi.ac.uk/
UCSC, http://genome.ucsc.edu/
dbSNP, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/
H-InvDB, http://www.h-invitational.jp/
VISTA, http://genome.lbl.gov/vista/
EnsEMBL, http://www.ensembl.org/
Reactome, http://reactome.org/
UniProt, http://www.uniprot.org/
wwPDB, http://www.wwpdb.org/
PDBj, http://www.pdbj.org/

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E-mail: t.imanishi [at] aist.go.jp