Hiroki SHIMIZU Homepage

産総研
last updated 2023 .9.19
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Profile
清水弘樹(Hiroki SHIMIZU)
国立研究開発法人産業技術総合研究所
細胞分子工学研究部門(ウェブサイト
多細胞システム制御研究グループ(ウェブサイト) 主任研究員
〒305-8568 305-0068 茨城県つくば市梅園1-1-1 中央第6
TEL:050-3848-6131/070-4836-4708
E-mail:hiroki.shimizu*aist.go.jp(*を@に変更して使用してください。)
学歴
  • 1991年 東京大学農学部農芸化学科卒業 (有機合成化学研究室:森 謙治 教授)
  • 1996年 東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命科学専攻博士課程修了 (同:北原 武 教授)
  • 1996年 博士(農学)(東京大学)「ポリラクトサミン糖鎖の合成研究」 *理研にて外研 
経歴
  • 1996年 ~1997年 理化学研究所国際フロンティア フロンティア研究員 (Dr. C. -H. Wong)
  • 1997年 ~1999年 the University of St. Andrews (Scotland, U.K.) 博士研究員
  •              (Prof. S. W. Homans,Dr. R. A. Field )
  • 1999年 ~2001年 University of Leeds (England, U.K.) 博士研究員 (Prof. S. W. Homans)
  • 2002年 ~2004年 東北大学大学院生命科学研究科 助手  (大類 洋 教授)
  • 2004年        独立行政法人産業技術総合研究所(北海道センター)糖鎖工学センター 研究員
  • 改組、異動等経て  現在 国立研究開発法人産業技術総合研究所(つくば第6事業所)
  •              細胞分子工学研究部門 多細胞システム制御研究グループ 主任研究員
研究内容

-分子制御化学研究-
「分子制御化学研究」すなわち、"分子を制御する化学""分子で細胞や生体機能を制御する化学"を指向した研究を進めています。(有機合成化学)
合成ターゲットを薬剤候補化合物や生理活性物質、すなわち細胞や生体機能を司る生体分子とその誘導体と設定し、これらの精密合成(ファインケミストリー)分野へマイクロ波を利用する研究を進めています。特に、マイクロ波の加熱特性に依らないマイクロ波による分子制御作用の抽出と利用により、これまで合成が困難もしくは不可能であった化合物の人工合成を目指しています。 また、その存在自体疑問視されかねないマイクロ波ならではの効果を明確化し、その作用機序の解明と利用展開をすすめ、新しい原理原則確立の可能性の探求などを進めています。      
      産総研

 マイクロ波を化学利用した生体分子の合成と利用展開する基盤研究、マイクロ波の産業利用を指向した出口研究、化学反応論に新たな展開をもたらす可能性を探るマイクロ波化学基礎研究などを進めています。
 基盤研究としては、マイクロ波を照射しても昇温しない反応システムを開発構築し、単純な加熱反応にとどまらず、糖鎖、糖鎖ペプチドなどの多官能基性の生理活性物質合成への展開を進めています。具体的には、これまで合成困難だった「異なった糖構造を複数有する複雑な糖ペプチドの実践合成研究」や「新薬候補化合物や薬補助剤など生体機能を制御する分子の効率合成研究」などを進めています。そして、合成した化合物を利用して生化学分野や創薬、医学分野などへの2次研究展開を進めています。
 そして、化学反応におけるマイクロ波の作用機序を分子レベルで解明し、化学反応の新しい見解、原理・理論確立を指向した基礎研究展開を目指しています。 化学反応における「熱」の概念が変わるかもしれません!
 これらの基盤研究と基礎研究を礎にした出口研究として、化学分野や生化学分野、高分子化学分野などにおけるマイクロ波利用の実践的な技術開発研究を展開しています。

研究テーマ
・有機合成化学におけるマイクロ波利用と効果検証研究
・複雑な糖ペプチドの合成研究
・細胞を制御する生理活性物質、薬剤候補化合物の合成研究
・マイクロ波利用による省エネルギー、環境制約対応技術開発
  など

研究実績

1.原著論文
1) Shimizu, Hiroki; Ito, Yukishige; Ogawa, Tomoya "PeSeNPhth-TMSOTf as a Promoter of Thioglycoside", SYNLETT, 535-536 (1994).
2) Watanabe, Hidenori; Shimizu, Hiroki; Mori, Kenji "Synthesis of Compounds with Juvenile Hormone Activity; XXXI: Stereo Controlled Symthesis of (+)-Juvabion from Chiral Sulfoxide", SYNTHESIS, Special Issue 25th Anniversary, 1246-1254 (1994).
3) Shimizu, Hiroki; Ito, Yukishige; Natsuzaki, Yuji; Iijima, Hiroyuki; Ogawa, Tomoya; "4,5-Dichloro-phthaloyl Group for Amino Protection in Carbohydrate Chemistry", Biosci. Biotechnol. Biochem., 60, 73-76 (1996).
4) Shimizu, Hiroki; Ito, Yukishoge; Kanie, Osamu; Ogawa, Tomoya; "Solid Phase Synthesis of Poly-lactosamine Oligosaccharide", Bioorg. Med. Chem. Lett., 6, 2841-2846 (1996).
5) Shimizu, Hiroki*;Brown, Jonathan M.; Homans, Steven W.; Field, Robert A. "Chemical Synthesis of 13C-Labelled Ganglioside Gb3 Trisacharide from [U-13C]-D-Glucose", Tetrahedron, 54, 9489-9506 (1998).
6) Shimizu, Hiroki; Field, Robert A.; Homans, Steven W.; Donohue-Rolfe, Art "Solution Structure of the Complex between the B-subunit Homopentamer of Verotoxin VT-1 from Escherichia coli and the Trisaccharide Moiety of Globotriaosylceramide", Biochemistry, 37, 11078-11082 (1998).
7) Shimizu, Hiroki; Donohue-Rolfe, Art; Homans, Steven W. "Derivation of the Bound-State Conformation of a Ligand in a Weakly Aligned Ligand-Protein Complex", J. Am. Chem. Soc., 121, 5815-5816 (1999).
8) Shimizu, Hiroki; Field, Robert A.; Homans, Steven W., "Solution Phase Conformation studies of a Weakly Aligned Oligosaccharide-Protein Complex Employing NMR, DYnamic Simulated Calculation and 13C-Enriched Oligosaccharide Synthesis", Glycoconjugate j., 16, S8 (1999).
9) Thompson, Gary S., Shimizu, Hiroki; Homans, Steven W.; Donohue-Rolfe, Art "Location of the Binding Site for Oligosaccharide Moiety of Gb3 on Verotoxin 1 Using NMR Residual Dipolar Coupling Measurements", Biochemistry, 39, 13153-13156 (2000).
10) Kitov, Pavel I., Shimizu, Hiroki; Homans Steven W.; Bundle, David R. "Optimization of Tether Length in Nonglycosidically Bivalent Ligands That Target Site 2 and 1 of a Shiga-like Toxin", J. Am. Chem. Soc., 125, 3284-3294 (2003).
11) Yoshioka,Takahiko; Shimizu, Hiroki; Ohrui, Hiroshi "Synthesis of (3R, 4S)-3,4,5-Trihydroxy-4-methylpentylphosphonic Acid as a Potential Inhibitor of Nonmenalonate Parhway", Biosci. Biochnol. Biochem., 68, 1259-1264 (2004).
12) Darana, Antonio; Shimizu,Hiroki; Homans, Steven W. "Thermodynamic of Binding of D-Galactose and Deoxy-derivatines There of the L-Arabinose-Binding Protein", J. Am. Chem. Soc., 126, 11870-11876 (2004).
13) Matsushita, Takahiko; Hinou, Hiroshi; Kurogochi, Masaki; Shimizu, Hiroki; Nishimura, Shin-Ichiro "Rapid Microwave-Assisted Solid-Phase Glycopeptide Synthesis", Org. Lett., 7, 877-880 (2005).
14) Ohrui, Hiroshi; Kato, Rumiko; Kodaira, Teruhisa; Shimizu, Hiroki; Akasaka, Kazuaki; Kitahara, Takeshi "Development of Highly Potent D-Gulucosamine-Based Chiral Fluorescent Labeling Reagents and a Microwave-Assisted β-Selective Glycosylation of a Methyl Glycoside Donor", Biosci. Biotechnol. Biochem.,69, 1054-1057 (2005).
15) Yoshimura, Yayoi; Shimizu*, Hiroki; Hinou, Hiroshi; Nishimura, Shin-Ichiro "A Novel Glycosylation Concept; Microwave-Assisted Acetal-Exchange Type Glycosylations from Methyl Glycosides as donors", Tetrahedron Lett., 46, 4701-4705 (2005).
16) Fumoto, Masataka; Hinou, Hiroshi; Ohta, Takashi; Ito, Takaomi; Yamada, Kuriko; Takimoto, Akio; Kondo, Hirosato; Shimizu,Hiroki; Inazu, Toshiyuki; Nakahara, Yoshiaki; Nishimura, Shin-Ichiro "Combinatorial Synthesis of MUC1 Glycopeptides: Polymer Blotting Facilitates Chemical and Enzymatic Synthesis of Highly Complicated Mucin Glycopeptides", J. Am. Chem. Soc., 127, 11804-11818 (2005).
17) Hinou, Hiroshi; Kurogochi, Masaki; Shimizu, Hiroki; Nishimura, Shin-Ichiro "Characterization of Vibrio Cholerae Neuraminidase by a Novel Mechanism-Based Fluorescent Labeling Reagent", Biochemistry, 44, 11669-11675 (2005).
18) Hinou, Hiroshi; Fumoto, Masataka; Ohta, Takashi; Matsushita, Takahiro; Yamada, Kuriko; Iwata, Kazumichi; Toda, Atsushi; Nishiguchi, Susumu; Ito, Takaomi, Takimoto, Akio; Kondo, Hirosato; Shimizu, Hiroki; Nakagawa, Hiroaki; Deguchi, Kisaburo; Nakahara, Yoshiaki; Inazu, Toshiyuki; Nishimura, Shin-Ichiro "A Versatile Synthesis of System of Conplex Glycopeptides", Glucoconjugate J., 22, 193-194 (2005).
19) Yoshimura, Yayoi; Shimizu*, Hiroki, Hinou, Hiroshi; Nishimura, Shin-Ichiro "A Novel Microwave Assisted Glycosylation Using a Methyl Glycoside as a Donor", Glycoconjugate J., 22, 194-195 (2005).
20) Shimizu, Hiroki*; Fujitani, Naoki; Ohta, Takashi; Nagahori, Noriko; Komata, Yuuki; Miura, Nobuaki; Matsubara, Teruhiko; Sato, Toshinori; Nishimura, Shin-Ichiro "Conformational Studies of a Fifteen Amino Acid residue Peptide Binding to the GM1 Oligosaccharide", Glycoconjugate J., 22, 261 (2005).
21) Matsushita, Takahiko; Hinou, Hiroshi; Fumoto, Masataka; Kurogochi, Masaki; Fujitani, Naoki; Shimizu, Hiroki; Nishimura, Shin-Ichiro "Construction of Highly Glycosylated Mucin-Type Glycoprptides Based on Microwave-Assisted Solid-Phase Syntheses and Enzymatic Modifications", J. Org. Chem., 71, 3051-3063 (2006).
22) Ohyabu, Naoki; Matsushiya, Takahiko; Hinou, Hiroshi; Izumi, Ryukou; Shimizu, Hiroki; Kondo, Hirosato; Nishimura, Shin-Ichiro "Construction of MUC1 Related Compound Library", Glucobiology, 16, 1152 (2006).
23) Naruchi, Kentarou; Hamamoto, Tomoki; Kurogochi, Masaki; Hinou, Hiroshi; Shimizu, Hiroki; Matsushita, Takahiko; Fujitani, Naoki; Kondo, Hirosato; Nishimura, Shin-Ichiro "Construction and Structual Characterization of Versatile Lactosaminoglycan-Related Compound Library for the Synthesis of Complex Gkycopeptides and Glycosingolipids", J. Org. Chem., 71, 9609-9621 (2006).
24) Shimizu, Hiroki*; Sakamoto, Masahiro; Nagahori, Noriko; Nishimura, Shin-Ichiro "A New Glycosylation Method Part Ⅱ; Study of Carbohydrate Elongation onto the Gold Nanoparticles in a Colloidal Phase", Tetrahedron, 63, 2418-2425 (2007).
25) Fujitani, Naoki; Shimizu*, Hiroki; Matsubara, Teruhiko; Ohta, Takashi; Komata, Yuuki; Miura, Nobuaki; Sato, Toshinori; Nishimura, Shin-Ichiro "Structural Transition Study of a 15 Acid Residue Peptide Induced by GM1", Carbohydr. Res., Special Issu; Glycomimetics, 342, 1895-1903 (2007).
26) Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki*; Matsushita, Takahiko; Nishimura, Shin-Ichiro "Chemical and enzymatic synthesis of neoglycolipids in the presence of cyclodextrins", Tetrahedron Lett., 49, 3413-3418 (2008).
27) Yamamoto, Kazunori; Sato, Yu; Ishimori, Ayumi; Miyairi, Kazuo; Okuno, Toshikatsu; Nemoto, Nobuaki; Shimizu, hiroki; Kidokoro, Shunichi; Hashimoto, Masaru "Synthesis of D-trigalacturonic acid methylglycoside and conformational comparison with its sulfur analogue", Biosci. Biotechnol. Biochem., 72 (8), 2039-2048 (2008).
28) Shimizu, Hiroki*; Yoshimuya, Yayoi; Hinou, Hiroshi; Nishimura, Shin-Ichiro "New Glycosylation Method Part Ⅲ: Study of Microwave Effects at Low Temperatures to Control Reaction Pathways and Reduce Byproducts", Tetrahedron, 64 (43), 10091-10096 (2008).
29) Matsushita, Takahiko; Sadamoto, Reiko; Ohyabu, Naoki; Nakata, Hideki; Fumoto, Masataka; Fujitani, Naoki; Takegawa, Yasuhiro; Sakamoto, Takeshi; Kurogochi, Masaki; Hinou, Hiroshi; Shimizu, Hiroki; Ito, Takaomi; Nishimura, Shin-Ichiro "Functional Neoglycopeptides: Synthesis and Characterization of New Class MUC1 Glycoprotein Models Having Core 2-based O-Glycan and Complex-type N-Glycan Chains", Biochemistry, 48, 11117-11133 (2009).
30) Ohyabu, Naoki; Hinou, Hiroshi; Matsushita, Takahiko; Izumi, Ryukou; Shimizu, Hiroki; Kawamoto, Keiko; Numata, Yoshito; Togame, Hiroko; Takemoto,Hiroshi; Kondo, Hirosato; Nishimura, Shin-Ichiro "An Essential Epitope of Anti MUC1 Monoclonal Antibody KL-6 Revealed by Focused Glycopeptide Library", J. Am. Chem. Soc., 131, 17102-17109 (2009).
31) Gaonkar, Santosh Laxman; Shimizu, Hiroki* "Microwave assisted synthesis of the antihyperglycemic drug rosiglitazone", Tetrahedron, 66, 3314-3317 (2010).
32) 杉山順一, 清水弘樹, 小田島博道, 大根田訓之, 望月浩貴 岡本正, 長島生, 太田英順「矩形M110共振器を用いたコンビナトリアルケミストリー用マイクロ波照射機の特性」電子情報通信学会技術研究報告会(信学技報), MW2010-10, 51-56pp, (2010).
33) Shimizu, Kazumi Hiruma; Hosoguchi, Kensaku; Liu, Yan; Fujitani, Naoki; Ohta, takashi; Hinou, Hiroshi; Matsushita, Takahiko; Shimizu, Hiroki; Feizi, Ten; Nishimura, Shin-Ichiro "Chemical synthesis, folding, and structual insights into O-fucosylated epidermal growth factor-like repeat 12 of mouse Notch-1 receptor", J. Am. Chem. Soc., 132, 14857-14865 (2010).
34) Matsushita, Takahiko; Nagashima, Izuru; Fumoto, Masataka; Ohta, Takashi; Yamada, Kuriko; Shimizu, Hiroki; Hinou, Hiroshi; Naruchi, Kentoro; Ito, Takaomi; Kondo, Hirosato; Nishimura, Shin-Ichiro "Artifical Golgi apparatus: Globuler protein-like dendrimer facilitates fully automated enzymatic glycan synthesis", J. Am.Chem. Soc., 132, 16651-16656 (2010).
35) Gaonkar, Santosh L.; Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki* "Microwave assisted solution phase synthesis of novel 2-[4-(2-N-methyl-2-pyridylamino)ethixy] phenyl]-5-substituted-1,3,4-oxadiazole library", Org. Chem. Int., doi:10.1155/2011/751894, Volume 2011, Article ID 751894 (2011).
36) Yamada, Keiichi; Nagashima, Izuru; Hachisu, Masakazu; Matsuo, Ichiro; Shimizu, Hiroki* "Efficient Solid-phase Synthesis of Cyclic RGD peptide under Cintrolled Microwave Heating", Tetrahedron Lett., 53(9), 1066-1070 (2012).
37) Nagashima, Izuru; Mine, Toshiki; Yamamoto, Takeshi; Shimizu, Hiroki* "Efficiency of organic solvents on the ability of β-2,3-sialyltransferase from Photobacterium sp. (JT-ISH-224) to control a hydrolysis side reaction", Carbohydr. Res., 358, 31-36 (2012).
38)  Matsushita, Takahiko; Ohyabu, Naoki; Fujitani, Naoki; Naruchi, Kentaro; Shimizu, Hiroki; Hinou, Hiroshi; Nishimura, Shin-Ichiro "Site-specific conformational alteration induced by sialylation of MUC1 tandem repeating glycopeptides at an epitope region for the anti-KL-6 monoclonal antibody", Biochemistry, 52(2), 402-424 (2013).
39) Izumi, Ryukou; Matsushita, Takahiko; Fujitani, Naoki; Naruchi, Kentaro; Shimizu, Hiroki; Tsuda, Sakae; Hinou, Hiroshi; Nishimura, Shin-Ichiro "Microwave-Assisted Solid-Phase Synthesis of Antifreeze Glycopeptides", Chem. Eur. j., 19(12), 3913-3920 (2013).
40) Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki* "Studies of Cyclodextrin Effect for Glycosylation by Galactosyltransferase", Tetrahedron, 70(19), 3146-3154 (2014).
41) Nagashima, Izuru; Sugiyama, Jun-Ichi; Sakuta, Tomomi; Sasaki, Masahide; Shimizu, Hiroki* "Efficiency of 2.45 and 5.80 GHz microwave irradiation for a hydrolysis reaction by thermostable β-Glucosidase HT-1", Biosci. Biotechnol. Biochem., 78(5), 758-760 (2014).
42) Enomoto, Masaru; Kitagawa, Wataru; Yasutake, Yoshiaki; Shimizu, Hiroki* "Total Synthesis of Aurachins C, D and L, and Structurally Simplified Analog of Aurachin C", Biosci. Biochnol. Biochem., 78(8), 1324-1327 (2014).
43) Enomoto, Masaru; Igarashi, Yasuhiro; Sasaki, Masahide; Shimizu, Hiroki* "A mannose-recognizable chemosensor using gold nanoparticles functionalized with pradimicin, a nonpeptidec mannnose-binding natural product", Tetrahedron, 71(18), 2603-2609 (2015).
44) Shimizu, Kazumi-Himura; Shimizu, Hiroki; Thompson, Gary S.; Kalverda, Arnout P.; Patching, Simon G. "Deuterated detergents for structural and functional studies of membrane proteins: Properties, chemical synthesis and applications", Mol. Membr. Biol., 32(5-8), 139-155 (2015).
45) 上垣薫, 林正太郎, 清水弘樹, 山本進一, 小泉俊雄「3,4-エチレンジオキシチオフェンとジブロモフルオレンのパラジウム触媒直接的アリール化重縮合による共役系高分子合成:マイクロ波合成装置の重縮合に対する影響」日本電磁波エネルギー応用学会論文誌, 2(10), 10-17pp, (2018).
46) Yamasaki, Kazuhiro; Kubota, Tomomi; Yamasaki, Tomoko; Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki; Terada, Ryu-Ichiro; Nishigami, Hiroshi; Kang, Jiyoung; Tateno, Masaru; Tateno, Hiroaki "Structural basis for specific recognition of core fucosylation in N-glycans by Pholiota squarrosa lectin (PhoSL)", Glycobiology, 29(7), 576-587 (2019).
47) Falconer, Adrian M. D; Chan, Chun Ming; Gray, Joseph; Nagashima, Izuru; Holland, Robert A.; Shimizu, Hiroki; Pickford, Andrew R.; Rowan, Andrew D.; Wilkinson, David J. "Collagenolytic matrix metalloproteinases antagonize proteinase-activated receptor-2 activation, providing insights into extracellular matrix turnover", J. Biol. Chem., 294(26), 10266-10277 (2019).
48) 横江孝之, 大木裕太, 長島生, 高橋直之, 清水弘樹*「低温マイクロ波利用が切り開いた糖ペプチド合成の汎用化」日本電磁波エネルギー応用学会論文誌, 3, 32-39pp, (2019).
49) Yoshimura, Yayoi; Denda-Nagai, Kaori; Takahashi, Yoshie; Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki; Kishimoto, Toshimitsu; Noji, Miki; Shichino, Shigeyuki; Chiba, Yasunori; Irimura, Tatsuro "Products of Chemoenzymatic Synthesis Representing MUC1 Tandem Repeat Unit with T-, ST- or Stn- antigen Revealed Distinct Specifities of Anti-MUC1 Antibodies", Sci. Rep., 9, 16641-16652 (2019).
50) Chafip, Maryam; Chaouiki, Abdelkarim; Lgaz, Hassane; Salghi, Rachid; Gaonkar, Santosh L.; Bhat, K. Subrahmanya; Marzouki, Riad; Ali, Ismat H.; Khan, Mohammad I.; Shimizu, Hiroki; Cyung, Ill-Min "Synthesis and corrosion inhibition evaluation of a new schiff base hydrazone for mild steel corrosion HCl medium: electrochemical, DFT, and molecular dynamizs simulations studies", J. Adhes. Sci. Technol, 34, 1283-1314 (2020).
51) Yoshimura, Yayoi; Nagashima, Izuru; Yokoe, Takayuki; Kishimoto, Toshimitsu; Shimizu, Hiroki; Choba, Yasunori "A new Strategy for Chemoenzymatic Synthesis of Glycopeptide through De-O-acetylation with an Esterase and Glycosylations with Glycosyltransferases", Carbohydr. Res., 492, Article 108023 (2020).
52) Kaga, Harumi; Enomoto, Masaru; Shimizu, Hiroki; Nagashima, Izuru; Matsuda, Keigo; Kawaguchi, Segou; Narumi, Atsushi "Microwave-assisted heating reactions of N-acetylglucosamine in sulfolane producing acetoamide derivatives of 1,6-anhdrosugars", Moleclars, 25, Article 1944 (2020).
53) Angata, Kiyohiko; Wagatsuma, Takanori; Togayachi, Akira; Sato, Takashi; Sogabe, Maki; Tajiri, Kazuto; Ozawa, Tatsuhiko; Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki; Iijima, Sayuki; Korenaga, Masaaki; Kuno, Atsushi; Kaji, Hiroyuki; Mizokami, Masashi; Narimatsu, Hisashi "O-glycosylated HBsAg peptide can induce specific antybody neutralizing HBV infection", Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 1866(1), 130020, (2022).
54) Kokubu, Ryoka; Ohno, Shiho; Kuratani, Hirohide; Takahashi, Yuka; Manabe, Noriyoshi; Shimizu, Hiroki; Chiba, Yasunori; Denda-Nagai, Kaori; Ysuiji, Makoto; Irimura, Tatsuro; Yamaguchi, Yoshiki "O-Glycan-Dependent Interaction between MUC1 Glycopeptide and MY.1E12 Antibody by NMR, Molecular Dynamics and Docking Simulations", Int. J. Mol. Sci., 23(14), 7855 (2022).
55) Yamasaki, Kazuhiko; Adachi, Naruhiko; Tun, Mya Myat Ngwe; Ikeda, Akihito; Moriya, Toshio; Kawasaki, Masato; Yamasaki, Tomoko; Kubota, Tomomi; Nagashima, Izuru; Shimizu, Hiroki; Tateno, Hiroaki; Morita, Kouichi "Core fucose-specific Pholiota squarrosa lectin (PhoSL) as a potent broad-spectrum inhibitor of SARS-CoV-2 infection", FEBS J., 290, 412-427, (2023).
56) Nagashima, Izuru; Sugiyama, Jun-ichi; Shimizu, Hiroki "Study of 400 MHz microwave conduction loss effect for a hydrolysis reaction by thermostable β-Glucosidase HT1", Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 87, 158-162 (2023).(部門トピックスウェブサイト

2.総合論文・総説・解説記事等
1) 清水弘樹「液晶NMR法を用いたたんぱく質の新しい構造解析研究」ぶんせきBumseki, 337, 51pp, (2003).
2) 清水弘樹「社会通念と科学的捏造」ぶんせきBunseki, 338, 109pp, (2003).
3) Shimizu, Hiroki "Studies on Molecular Interaction of Protein and Their Carbohydrate Ligands by NMR"; 清水弘樹「NMRによる糖鎖リガンドのたんぱく質接着作用研究」Trends. Glycosci. Glycotechnol. (TIGG), 15, 221-233pp, (2003).
4) 清水弘樹, 松下隆彦, 西村紳一郎「マイクロ波を利用した糖鎖・糖鎖ペプチド精密合成 (Microwave chemistry for glycosylation and oligopeptide synthesis)」高分子論文集 Koubunshi Ronbunsyu (Japanese Journal of Pulymer Science and Technology), 64, 883-896pp, (2007).
5) 清水弘樹「結合の角度から分子の立体構造を決める, 液晶NMR法」化学と生物, 46(9), 648-652pp, (2007).
6) 長島生, 清水弘樹「マイクロ波を利用した全合成ーペプチド, 糖鎖, 創薬ライブラリ, 薬剤プロセス合成, 酵素合成研究を通じてマイクロ波非加熱効果に迫る」有機合成化学協会誌, 70(3), 250-264pp, (2012).
7) 林正太郎, 清水弘樹, 小島督央, 山本進一, 小泉俊雄「3,4-エチレンジオキシチオフェンとジブロモカルバゾールの直接的アリール化重重縮合に関する検討 (Study on Direct Arylation Polycondensation of 3,4-Ethylenedioxythiophene with Dibromocarbazole)」高分子論文集 Koubunsi Ronbunsyu (Japanese Journal of Polymer Science and Technology), 74, 588-593pp, (2017).
8) 長島生, 清水弘樹「マイクロ波を利用したペプチド・糖ペプチド固相合成~マイクロ波はペプチド合成の発展に寄与し、糖ペプチド合成の発展にも資する」化学と生物, 56(12), 811-818pp, (2018).
9) 清水弘樹「マイクロ波酵素反応の作用機序を解き明かす」化学と工業, 73(3), 236-237pp, (2020).

3.著書
1) 清水弘樹, 西村紳一郎「グリコシル化の改良」複合糖質の化学と最新応用技術 (第1編 第6章), 53-62pp, シーエムシー出版, 2009.
2) 清水弘樹「マイクロ波を利用した糖鎖合成」ファインケミカル2011年5月号, 40(5), 38-43pp, シーエムシー出版, 2011.
3) 長島生, 清水弘樹「酵素化学合成法による糖鎖生産技術」バイオ医薬品開発における糖鎖技術 (第3編第8章), 85-95pp, シーエムシー出版, 2011.
4) 長島生, 清水弘樹「生体高分子合成 (糖鎖, ペプチド, 糖鎖ペプチド)」最新マイクロ波エネルギーと応用技術 (第5章5-3), 543-549pp, (株)産業技術サービスセンター, 2014.
5) 長島生, 清水弘樹「マイクロ波合成」糖鎖の新機能開発応用ハンドブック (第4編第1章4-4), (株)エヌ・ティー・エス, 2015.
6) 清水弘樹「マイクロ波照射による糖鎖・糖ペプチド合成」マイクロ波加熱の基礎と産業応用 (第6章第2節), (株)R&D支援センター, 2017.
7) 長島生, 清水弘樹「マイクロ波を利用した糖鎖・糖ペプチド精密合成」中分子創薬に資するペプチド・核酸・糖鎖の合成技術 (第Ⅳ編第7章), シーエムシー出版, 2018.
8) 清水弘樹「マイクロ波を用いたグリコシル化」月刊BIO INDUSTRY 2021年8月号, 38(8), 73-80pp, シーエムシー出版, 2021.